Áreas de densidade aumentada das seqüências de citosina--fosfatodiester--guanina dinucleotídeo . Formam fitas de
DNA com extensão de várias centenas a vários milhares de pares de bases. Em
humanos, há cerca de 45.000
ilhas de CpG encontradas principalmente nas
extremidades 5' dos
genes. Elas não são metiladas, exceto aquelas nos
cromossomos X inativos e algumas associadas com
genes impressos.